标签归档：mspi

MspI |NEB酶试剂 New England Biolabs

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs（NEB）酶试剂全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品信息

Msp I：DNA 共晶体（Lydia Dorner and Ira Schildkraut, New England Biolabs）

MspI |

产品来源

大肠杆菌菌株，其携带来自莫拉氏菌属（Moraxella）（ATCC 49670）的 MspI 基因。

产品类别:
Methylation Sensitive Restriction Enzymes for Epigenetics Products,
Restriction Enzymes for Epigenetic Analysis,
Epigenetic Analysis Products,

Restriction Endonucleases H M Products,

Time-Saver Qualified Restriction Enzymes Products

应用:
Restriction Enzymes for Epigenetics,
5-hmC Detection & Analysis,
Fast Cloning: Accelerate your cloning workflows with reagents from NEB,

Restriction Enzyme Digestion

  • 产品组分信息

    本产品提供以下试剂或组分：

    NEB # 名称 组分货号 储存温度 数量 浓度
    • R0106V     -20    
        MspI R0106VVIAL -20 1 x 0.125 ml 20,000 units/ml
        rCutSmart™ Buffer B6004SVIAL -20 1 x 1.25 ml 10 X
    • R0106S     -20    
        MspI R0106SVIAL -20 1 x 0.25 ml 20,000 units/ml
        rCutSmart™ Buffer B6004SVIAL -20 1 x 1.25 ml 10 X
        Gel Loading Dye, Purple (6X) B7024AVIAL 25 1 x 0.5 ml 6 X
    • R0106T     -20    
        MspI R0106TVIAL -20 1 x 0.05 ml 100,000 units/ml
        rCutSmart™ Buffer B6004SVIAL -20 1 x 1.25 ml 10 X
        Gel Loading Dye, Purple (6X) B7024AVIAL 25 1 x 0.5 ml 6 X
    • R0106L     -20    
        MspI R0106LVIAL -20 1 x 1.25 ml 20,000 units/ml
        rCutSmart™ Buffer B6004SVIAL -20 1 x 1.25 ml 10 X
        Gel Loading Dye, Purple (6X) B7024AVIAL 25 1 x 0.5 ml 6 X
    • R0106M     -20    
        MspI R0106MVIAL -20 1 x 0.25 ml 100,000 units/ml
        rCutSmart™ Buffer B6004SVIAL -20 1 x 1.25 ml 10 X
        Gel Loading Dye, Purple (6X) B7024AVIAL 25 1 x 0.5 ml 6 X

  • 特性和用法

    单位定义

    一个单位是指在 50 µl 的总反应体系中，在 37℃ 下，1 小时内酶切 1 µg λ DNA 所需的酶量。

    反应条件

    1X rCutSmart™ 缓冲液
    Incubate at 37°C

    1X rCutSmart™ 缓冲液
    50 mM Potassium Acetate
    20 mM Tris-acetate
    10 mM Magnesium Acetate
    100 µg/ml Recombinant Albumin
    (pH 7.9 @ 25°C)

    在不同缓冲液中的活性

    NEBuffer™ r1.1: 75%
    NEBuffer™ r2.1: 100%
    NEBuffer™ r3.1: 50%
    rCutSmart™ Buffer: 100%

    稀释兼容性

    • 稀释液 A

    贮存溶液

    10 mM Tris-HCl
    50 mM KCl
    1 mM DTT
    0.1 mM EDTA
    200 µg/ml Recombinant Albumin
    50% Glycerol
    pH 7.4 @ 25°C

    热失活

    否

    甲基化敏感性

    dam 甲基化: 不敏感
    dcm 甲基化: 不敏感
    CpG甲基化: 不敏感

    同裂酶

    BsiSI
    HapII
    HpaII

  • 相关产品

    相关产品

    • t1010-monarch-plasmid-miniprep-kit
    • Monarch® DNA 胶回收试剂盒
    • Monarch® PCR & DNA 纯化试剂盒（5 μg）

    单独销售的组分

    • rCutSmart™ 缓冲液
    • 6X 紫色凝胶上样染料

  • 注意事项

    1. MspI 是 HpaII 的同裂酶。当 CCGG 序列的外侧 C 碱基被甲基化时，MspI 和 HpaII 无法酶切。然而，与 HpaII 不同的是，MspI 在内侧 C 碱基被甲基化时，仍然可以酶切。

操作说明、说明书 & 用法

  • 操作说明

    1. Optimizing Restriction Endonuclease Reactions
    2. Restriction Digest Protocol
    3. Double Digest Protocol with Standard Restriction Enzymes

  • 使用指南

    • Activity at 37°C for Restriction Enzymes with Alternate Incubation Temperatures
    • Activity of Restriction Enzymes in PCR Buffers
    • Cleavage Close to the End of DNA Fragments
    • Digestion of Agarose-Embedded DNA: Info for Specific Enzymes
    • Double Digests
    • Effects of CpG Methylation on Restriction Enzyme Cleavage
    • Heat Inactivation
    • NEBuffer Activity/Performance Chart with Restriction Enzymes
    • Optimizing Restriction Endonuclease Reactions
    • Restriction Endonucleases – Survival in a Reaction
    • Restriction Enzyme Diluent Buffer Compatibility
    • Restriction Enzyme Tips
    • Single Letter Codes
    • Star Activity
    • Traditional Cloning Quick Guide

工具 & 资源

  • 选择指南

    • Alphabetized List of Recognition Sequences
    • Compatible Cohesive Ends and Generation of New Restriction Sites
    • Dam-Dcm and CpG Methylation
    • DNA Methylation Table
    • Frequencies of Restriction Sites
    • Isoelectric Points (pI) for Restriction Enzymes
    • Isoschizomers
    • NEB Diluent and Buffer Table
    • Recleavable Filled-in 5′ Overhangs
    • Restriction Enzymes for Epigenetics Selection Chart
    • Time-Saver™ Qualified Enzymes
    • Why Choose Recombinant Enzymes?

  • Web 工具

    • DNA Sequences and Maps Tool
    • Enzyme Finder
    • NEBcutter™ v3.0
    • NEBioCalculator®
    • REBASE®

FAQs & 问题解决指南

  • FAQs

    1. Do I have to set-up digests with Time-Saver™ qualified enzymes for 5-15 minutes? Can I digest longer?
    2. I tested your restriction enzyme on the substrate DNA recommended by NEB, and it appears to be active, however it does not digest my DNA. What could be the reason?
    3. Which NEB restriction enzymes are supplied with Gel Loading Dye, Purple (6X)?
    4. Is this enzyme sensitive to dam, dcm or mammalian CpG methylation?
    5. Can you tell me more about the switch from BSA to Recombinant Albumin (rAlbumin) in NEBuffers?

  • 问题解决指南

    • Restriction Enzyme Troubleshooting Guide

MspI 甲基转移酶 |NEB酶试剂 New England Biolabs

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs（NEB）酶试剂全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品信息

虽与 HpaII 甲基转移酶识别序列相同，但 MspI 甲基转移酶修饰 CCGG 序列的外侧胞嘧啶残基（C5）。

产品来源

大肠杆菌菌株，携带克隆自莫拉氏菌（Moraxella）属（ATCC 49670）的 MspI 修饰基因。

产品类别:
Methyltransferases for Epigenetics Products,
Methyltransferases Products

应用:
DNA Methylation Analysis

  • 产品组分信息

    本产品提供以下试剂或组分：

    NEB # 名称 组分货号 储存温度 数量 浓度
    • M0215S     -20    
        MspI Methyltransferase M0215SVIAL -20 1 x 0.02 ml 5,000 units/ml
        MspI Methylase Reaction Buffer B0215SVIAL -20 1 x 1 ml 10 X
        S-adenosylmethionine (SAM) B9003SVIAL -20 1 x 0.1 ml 32 mM

  • 特性和用法

    单位定义

    1 个单位是指在 37℃ 条件下，10 µl反应体系中，1 小时内能保护 1 µg λ DNA 不被 MspI 限制性内切酶切割所需酶量。

    反应条件

    1X MspI 甲基化酶反应缓冲液
    Supplement with 80 µM S-腺苷甲硫氨酸（SAM）
    Incubate at 37°C

    1X MspI 甲基化酶反应缓冲液
    50 mM Tris-HCl
    100 mM NaCl
    5 mM β-ME
    10 mM EDTA
    (pH 7.5 @ 25°C)

    对照保护实验

    MspI 甲基转移酶与 1 µg λ DNA 在 10 µl 补充了 80 µM S-腺苷甲硫氨酸的 1X MspI 甲基转移酶反应缓冲液中，于 37℃ 温育 1 小时，后于 65℃ 温育 15 分钟。MspI 甲基转移酶保护能力的测定是通过添加 40 µl 补充了 10 mM MgCl2 的 NEBuffer 2 和 5 单位 MspI 限制性内切酶。37℃ 条件下温育 MspI 后用琼脂糖凝胶电泳分析。

    贮存溶液

    50 mM Tris-HCl
    50 mM NaCl
    5 mM β-ME
    10 mM EDTA
    200 µg/ml BSA
    50% Glycerol
    pH 7.5 @ 25°C

    热失活

    否

    分子量

    理论上的: 40397 道尔顿

  • 相关产品

    单独销售的组分

    • S-腺苷甲硫氨酸（SAM）

  • 参考文献

    1. Hoffman, J.L. (1986). Biochemistry. 25, 4444-4449.

操作说明、说明书 & 用法

  • 操作说明

    1. Recommended Protocol for 3H labeling of DNA
    2. Recommended Protocol for Methylation of Genomic DNA

  • 使用指南

    • Dam and Dcm Methylases of E. coli

FAQs & 问题解决指南

  • FAQs

    1. Is S-adenosylmethionine (SAM) supplied with the Methyltransferase?
    2. What should be considered if the methylation is not going to completion?
    3. What is the molecular weight of MspI Methyltransferase?
    4. Will any NEB methyltransferases (methylases) work on RNA?

pBR322 DNA-MspI 消化 |NEB酶试剂 New England Biolabs

发表于由

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs（NEB）酶试剂全线产品，欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品信息

MspI 消化后的 pBR322 DNA 产生 26 个片段，适用作琼脂糖凝胶电泳的分子量标准（1,2）。

随附 1 管 6X 紫色凝胶上样染料，无 SDS。

  • 推荐凝胶百分比范围：2% – 3.5%
  • 3% 时可实现最佳分离

pBR322 DNA-MspI 消化 |
pBR322 DNA-MspI Digest visualized by ethidium bromide staining on a 3% agarose gel.
Suggested Load: 1 µg/ gel lane.
产品类别:
DNA Markers & Ladders Products

应用:
DNA Analysis

  • 产品组分信息

    本产品提供以下试剂或组分：

    NEB # 名称 组分货号 储存温度 数量 浓度
    • N3032S     -20    
        pBR322 DNA-MspI Digest N3032SVIAL -20 1 x 0.05 ml 1 mg/ml
        Gel Loading Dye, Purple (6X), no SDS B7025SVIAL 25 1 x 1 ml 6 X

  • 特性和用法

    碱基

    Fragment Mass (ng) bp
    1 143 622
    2 121 527
    3 93 404
    4 70 307
    5 55 242
    6 55 238
    7 50 217
    8 46 201
    9 44 190
    10 41 180
    11 74 160/160
    12 68 147/147
    13 28 123
    14 25 110
    15 21 90
    16 17 76
    17 15 67
    18 16 34/34
    19 12 26/26
    20 3 15
    21 4 9/9

    有效大小范围

    9bp to 622bp

    贮存溶液

    10 mM Tris-HCl
    1 mM EDTA
    pH 8 @ 25°C

  • 相关产品

    相关产品

    • 100 bp DNA Ladder
    • PCR Marker
    • 6X 紫色凝胶上样染料，无 SDS
    • t1010-monarch-plasmid-miniprep-kit
    • Monarch® DNA 胶回收试剂盒
    • Monarch® PCR & DNA 纯化试剂盒（5 μg）

    单独销售的组分

    • 6X 紫色凝胶上样染料，无 SDS

  • 注意事项

    1. 在 TE 或其它离子强度极低的缓冲液中稀释。如果在 dH2O 中稀释，DNA 可能会变性。

      1X 紫色凝胶上样染料，无 SDS：
      2.5% Ficoll®-400
      10 mM EDTA
      3.3 mM Tris-HCl（pH 8.0 @ 25℃）
      0.02% 染料 1
      0.001% 染料 2

  • 参考文献

    1. Sutcliffe, J.G. (1978). Cold Spring Harbor Symp. Quant. Bio.. 43, 77-90.
    2. Peden, K.W.C. (1983). Gene. 22, 277-280.

操作说明、说明书 & 用法

  • 操作说明

    1. Suggested Loading Protocol for DNA Ladders & Markers

       

FAQs & 问题解决指南

  • FAQs

    1. Why is the separation of the lower bands incomplete?
    2. What are the overhangs on the DNA ladder fragments? Can I end-label them using the T4 polynucleotide kinase (PNK)? What about the Klenow fragment?
    3. How can I quantify the amount of DNA in each band of a marker?
    4. Can I use Midori Green with the DNA Ladders from NEB?
    5. Can I use SYBR® and/or GelRed® dyes with the DNA Ladders from NEB?
    6. Why is my DNA Ladder floating out the wells and Why are there no bands visible in my DNA ladder gel lane?

  • 实验技巧

    要想配制成即用型，应以 TE 缓冲液而非水稀释。