SCALEVIEW®-S4 球状体·细胞用透明化试剂

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  • 参考文献

SCALEVIEW®-S4                              球状体·细胞用透明化试剂球状体·细胞透明化试剂

SCALEVIEW®-S4

SCALEVIEW®-S是组织透明化试剂。可通过使用SCALEVIEW®-S0 – SCALEVIEW®-SMt等六种产品进行组织透明化处理。

其中,可单独使用SCALEVIEW®-S4透明化球状体或细胞。只需将目标样品浸入SCALEVIEW®-S4即可。


◆特点


● 只需浸泡即可实现简单透明化

● 透明化耗时短(1日左右)

● 不需要特殊的设备

● 可配合荧光抗体标记和荧光素观察

◆T47D细胞球状体观察实例

Data by Molly E, Boutin, et al. : Scientific Reports, 8, 11135 (2018).


SCALEVIEW®-S4                              球状体·细胞用透明化试剂

图1. SCALEVIEW®-S4透明化T47D细胞球体的图像示例(细胞核使用Hoechst染色)4

       使用共聚焦显微镜Z-堆叠获得的球状体图像。



SCALEVIEW®-S4                              球状体·细胞用透明化试剂


2. T47D细胞球状体经诺考达唑处理后,使用组蛋白H3抗体的测量实例。

       通过SCALEVIEW®-S4的透明化处理,可观察药物施用对球状体表面和内部的影响。


◆操作步骤图示


SCALEVIEW®-S4                              球状体·细胞用透明化试剂

◆SCALEVIEW®-S4 Neurosphere的观察实例

数据提供:

国立研究开发法人理化学研究所

脑神经科学研究中心细胞技能探索技术研究组/ 光量子工学研究中心生命光学技术研究组 滨裕先生、星田哲志先生、宫脇敦史先生

协助:olympus 株式会社



Neurosphere的观察实例

(※试剂使用量推荐前处理和透明化均为各试剂:1.2 mL。※荧光抗体标记基于AbScale方案。)


固定 前处理
灌注固定+固定
4%PFA/PBS(-)
【pH 7.6-7.8】
前处理1
SCALEVIEW®-S0
透明处理1
SCALEVIEW®-A2
透明处理2
8 M Urea Solution
透明处理3    SCALEVIEW®-A2 洗净
deScale Solution
4 ℃, 3 day 37 ℃, 4 hr 37 ℃, 4 hr

37 ℃,

12 hr

37 ℃, 4 hr 4 ℃, 6 hr

荧光抗体标记 透明化 观察

Blocking

1% Blocking Reagent(Roche)/

    PBS(-)

抗体标记【例:标记Iba1抗体】
AbScale Solution
洗净
AbScale Solution
再固定
4% PFA/PBS(-)【pH 7.6-7.8】
洗净
 deScale Solution
透明化

 SCALEVIEW®-S4

37 ℃,4 hr

固定
SCALEVIEW®-S4
摇动1小时后固定*
室温,2 hr 37 ℃, >1 day

室温,  

2 hr ×1、

1 hr ×1

室温,1 hr 4 ℃,3 hr 37 ℃,4 hr 室温

*透明化后,使用1.5%(wt / vol)琼脂糖嵌入并固定。

成年大鼠海马神经干细胞神经球状体的三维免疫荧光  —使用AbScale法—


SCALEVIEW®-S4                              球状体·细胞用透明化试剂

参考文献


1) Hama,H.et al. : Nature Neuroscience 14, 1481(2011).

2) Hama,H.et al. : Nature Neuroscience 18, 1518(2015).

3) Hama H, et al. : Protocol Exchange (2016), doi:10.1038/protex.2016.019

4) Molly E, Boutin, et al. : Scientific Reports, 8, 11135 (2018).

◆产品信息


产品编号 产品名称 规格 包装
194-18561 SCALEVIEW-S4
SCALEVIEW-S4组织透明化试剂
组织透明化用 250 mL

◆相关产品


产品编号 产品名称 规格 包装
193-18455 SCALEVIEW-A2
SCALEVIEW® 组织透明化试剂A2
组织透明化用 500 mL
196-18521 SCALEVIEW-S0
SCALEVIEW® 组织透明化试剂S0
组织透明化用 250 mL
041-34425 deScale Solution
透明化洗涤溶液
组织透明化用 500 mL
294-35631 See Through Chamber, 0.3mm thick
透明室,0.3mm厚
组织透明化用 10 set
291-35641 See Through Chamber, 0.5mm thick
透明室,0.5mm厚
组织透明化用 10 set
295-35661 See Through Chamber, 1.0mm thick
透明室,1.0mm厚
组织透明化用 10 set
292-35671 See Through Chamber, 2.0mm thick
透明室,2.0mm厚
组织透明化用 10 set
299-35681 See Through Chamber, 3.0mm thick
透明室,3.0mm厚   
组织透明化用 10 set


※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。

相关资料

SCALEVIEW®-S4                              球状体·细胞用透明化试剂

透明化试剂方法选择流程

组织透明化试剂Q&A ver1.0

Tissue clearing reagent Q&A ver1.0

Q组织透明化的原则

A:组织透明化通常是按下面的步骤进行的:

A:(a)固定 (b)透化 (c)脱色 (d)折射率匹配

 

Q:组织透明化的优势

A:目前大多数可用的透明化技术,都是通过编码荧光报告蛋白或者用荧光标记抗体进行后标记,从而可视化组织中特定的蛋白。组织透明化成为

A:了具有单细胞分辨率的组织3D成像中重要的一环。

 

Q:透明化技术的比较

A:下面是水性的透明化技术。


SCALEVIEW®-S4                              球状体·细胞用透明化试剂


SCALEVIEW®-S4                              球状体·细胞用透明化试剂


A:SeeDB(基于果糖的方法)在一些应用中有一定优势。因为SeeDB不含去垢剂,所以对于透明化DiI(细胞膜红色荧光探针,一种神经示踪剂)

A:标记的样品和使用光电关联显微镜(CLEM)的情况下,SeeDB有着一定优势。另外SeeDB会产生自体荧光,有时候会对辨认未标记的神经元

A:结构(如神经毡)起着一定帮助。

A:SeeDB2是为使用高NA物镜的高分辨率成像而优化的技术,因此,当处理较大的组织时,CLARITY或者CUBIC会是更好的选择。

 

Q:切片厚度的最大值和最小值?

A:您应该根据您的物镜的WD(工作距离)来决定切片的厚度。我们建议切片的厚度不要超过3mm。对于十分薄且脆弱的样品,我们建议使用琼

A:脂糖包埋。

A:使用CUBIC,可以让全器官、全身透明化和使用LSFM的快速3D成像具有可重复性。

 

Q:试剂盒成分

A:具体如下:

A:1. SCALEVIEW-S试剂盒(299-79001)适用于20份 1-2 mm 的切片样品

A:A:1) SCALEVIEW-S0——100 mL

A:A:2) SCALEVIEW-S1——100 mL

A:A:3) SCALEVIEW-S2——100 mL

A:A:4) SCALEVIEW-S3——100 mL

A:A:5) SCALEVIEW-S4——100 mL

A:A:6) SCALEVIEW-SMT——100 mL

 

A:2. SCALEVIEW-S试剂盒(290-80801)适用于20-30份 1-2 mm 的切片样品。

A:A:1) SCaleCUBIC-1 Solution——250 mL

A:A:2) SCaleCUBIC-2 Solution——250 mL

A:A:3) Mounting Solution 1——40 mL

A:A:4) Mounting Solution 2——40 mL

 

A:3. SeeDB试剂盒(299-79901)适用于20-30份 1-2 mm 的切片样品。

A:A:1) SeeDB:20w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:2) SeeDB:40w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:3) SeeDB:60w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:4) SeeDB:80w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:5) SeeDB:100w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:6) SeeDB——50 mL

 

A:4. SeeDB2试剂盒(294-80701)适用于20-30份 1-2 mm 的切片样品。

A:A:1) Saponin(皂角苷)——5g

A:A:2) SeeDB2G solution——50mL

A:A:3) SeeDB2S solution——50mL

A:A:4) PBS——50mL

 

Q:样品的保存

A:SCALEVIEW-S处理的样品应在室温下保存2~3周。您可以在2~3周内观察SCALEVIEW-S透明化的样品中的荧光信号。

A:CUBIC处理的样品应在室温下保存1周。您可以在1周内观察CUBIC透明化的样品中的荧光信号。

A:SeeDB2G处理的样品应在冰箱中保存1年,而SeeDB2S处理的样品则可在室温下保存1年。您可以在1年内观察SeeDB透明化的样品中的荧光

A:信号。

 

Q:抗体的荧光标记

A:应在进行透明化前就进行抗体的荧光标记。

 

Q:适用于SCALEVIEW-S的显微镜

A:SD-OSR(Olympus)

A:FV-OSR(Olympus)

 

Q:适用于CUBIC的显微镜

A:SD-OSR(Olympus)

A:FV-OSR(Olympus)

A:Zeiss Lightsheet Z.1(Carl Zeiss)

 

Q:适用于SeeDB2的显微镜

A:Confocal(最好使用高NA的油浸镜头)

A:STED(Leica Microsystems)

A:SR-SIM(Carl Zeiss)

A:SD-OSR(Olympus)

A:FV-OSR(Olympus)

A:Airyscan(Carl Zeiss)

A:HyVolution(Leica Microsystems)

A:Two-photon(最好使用复合浸没镜头)

A:Confocal(最好使用高NA的甘油浸镜头)

A:Light-sheet DLS(Leica,最好使用定制镜面的设备)

 

Q:重构

A:对于定量用途,我们建议使用Neurolucida系统(MBF)。我们同样测试了VAST Lite用于成像用途时的表现。重构时也可以使用开源软件。

A:例如,Vaa3d可以处理大量的拼接图像的数据。

 

Q:物镜推荐

SCALEVIEW®-S4                              球状体·细胞用透明化试剂

 

Q:其他物种?其他器官?

A:对于昆虫样品和鱼类样品,建议选择CUBIC。

A:昆虫相关文献:Ohuma.et al.: Fish Pathology, 52(2), 96(2017).

A:鱼类相关文献:Konno and S.Okazaki .: Zoological Letters, 4:13(2018).

   

  对于多细胞球状体,选择SCALEVIEW-S会更好。

  https://www.nature.com/articles/s41598-018-29169-0

 

参考文献


1) Hama,H.et al. : Nature Neuroscience 14, 1481(2011).

2) Hama,H.et al. : Nature Neuroscience 18, 1518(2015).

3) Hama H, et al. : Protocol Exchange (2016), doi:10.1038/protex.2016.019

4) Molly E, Boutin, et al. : Scientific Reports, 8, 11135 (2018).

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级

脂质除去用电泳槽使脑部透明化 Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

  • 产品特性
  • 相关资料
  • Q&A
  • 参考文献

脂质除去用电泳槽使脑部透明化脂质除去用电泳槽使脑部透明化                              Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

          新型电泳槽使脑部透明化!!NA-1880 型电泳槽,可用于去除脂质

2013 年4 月11 日的自然杂志(Nature)电子版里介绍了组织透明化技术 CLARITY 法电泳去除脂质的方法,斯坦福大学的 Karl Deisseroth 教授等因此受到关注。这个方法的步骤是,向样品灌注并使其结合丙烯酰胺后,37℃电压 10 V~40 V 通电3小时引发聚合, 40℃ 10 V–60 V 电压电泳2天,循环含4%SDS 的硼酸盐缓冲液,去除脂质,使样品透明化。透明化的样品可用于后续的免疫染色分析。



脂质除去用电泳槽使脑部透明化                              Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

Nature 论文中的电泳装置:

样品使用 18 mm 的小鼠脑,电泳槽是电极间距 20 mm,高度20mm,内部直径为 40 mm 的圆筒状密闭循环型装置。为了安全,电泳槽上部还连接了硅胶密封的螺纹出口。

外连装置:

缓冲液循环泵(推荐使用 100 mL/min 以上的型号),能用于高电流的电泳电源(3860 型、3870 型等)、保温范围在 37~50℃的恒温水槽、加热器和 5 L 缓冲液槽。

脂质除去用电泳槽使脑部透明化                              Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

规格:

主要材料:亚克力;

电极部分:铂金线、引线;

内置下槽(接续部分防水处理),附接续循环软管、滚动夹1个、异型软管接头2个

尺寸:70 mm x 70 mm x 90 mm;

重量:0.2 kg;

槽内部直径 40 mm 电极间距 20 mm;

耐热温度 65℃ * 铂金线直径 0.3 mm;

规格、尺寸等有可能变更。如有需要可订做电泳置,也可咨询直径 0.5 mm 型铂金线。

组织透明化辅助试剂

VA-044(聚合物引发剂)

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级
631-26271 Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction
脂质除去用电泳槽
1 台 免疫化学用

SCALEVIEW-S 组织透明化试剂

  • 产品特性
  • 相关资料
  • Q&A
  • 参考文献

组织透明化试剂SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂

SCALEVIEW®-S


  ScaleS技术由一组主要成分为尿素和山梨糖醇的组织透明化试剂组成。

  开发此技术的理化研究所·脑神经科学研究中心和光量子工学研究中心通过进一步改良,研发出兼备出色透明度和可保留细微结构及荧光信号的新成果。

  FUJIFILM Wako取得理化研究所的许可,把此项成果商品化,推出SCALEVIEW®-S产品。

  SCALEVIEW®-S 不仅可以透明化含有荧光蛋白的生物标本,而且也可以有效应用于抗体或荧光染料标记的厚标本。它将有望成为分析脑组织病理标本的有力工具。

  SCALEVIEW®-S Trial Kit主要由从SCALEVIEW®-S0到SCALEVIEW®-SMt等6种试剂组成,可通过使用各试剂进行透明化的试剂盒。


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂


数据提供:

国立研究开发法人理化学研究所

脑神经科学研究中心细胞机能探索研究组/光量子工学研究中心生命光学技术研究组

濱裕先生、星田哲志先生、宮脇敦史先生

合作:olympus株式会社



◆SCALEVIEW®-S 组织透明化实验报告例子


■ 小鼠大脑半球1-2 mm厚切片

(※试剂用量标准:透明化处理和固定各5 mL。)


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂


※在组织透明化实验中,请注意试剂的使用量、处理的时间根据样本大小会有所改变。

此外,请尽可能在灌注固定后取出并重新固定样本。

 


■ 使用SCALEVIEW®-S小鼠大脑透明化例子


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂


从左依次是小鼠大脑切片(1mm厚)SCALEVIEW®-S处理前后和小鼠大脑半球SCALEVIEW®-S处理前后

 


■ 用双光子激发显微镜观察YFP-H line系小鼠透明化全脑——逐步放大基底神经节区域


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂


点击查看protocol



◆免疫组织染色:AbScale 实验报告


■ 小鼠大脑半球1-2 mm厚切片

(※试剂用量标准为前处理各试剂:10 mL、抗体染色:1.5 mL、透明化:10 mL、固定:10 mL。)


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂


* AbScale Solution : 含0.33 M 尿素、0.1 % (wt/vol) Triton X-100的PBS(-)溶液

 

■ 阿尔茨海默病模型小鼠(17个月)大脑切片(2mm厚)通过AbScale法进行免疫组织染色的图

   像例


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂



◆荧光染料染色:ChemScale 实验报告


■ 小鼠大脑半球1-2 mm厚切片

(试剂用量标准为前处理各试剂:10 mL、荧光染料染色:8 mL、洗涤:10 mL、透明化:10 mL)


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂



■ 用共聚焦激光扫描显微镜(倒立)观察ChemScale处理(PI染色)后的YFP-H line小鼠大脑半球

     切片(2 mm厚)


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂



◆SCALEVIEW®-S Neurosphere观察示例


■ Neurosphere

(试剂用量标准:前处理及透明化各试剂1.2 mL。※抗体染色基于AbScale实验报告)


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂



■ 从成年大鼠海马体制备的神经干细胞Neurosphere三维免疫染色——使用AbScale法


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂


※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。

组织透明化配套耗材:成像用透明室

SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂

SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂

透明化试剂方法选择流程

AbScale发进行直接IHC实验步骤

SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂

组织透明试剂化系列

组织透明化试剂Q&A ver1.0

Tissue clearing reagent Q&A ver1.0


Q组织透明化的原则

A:组织透明化通常是按下面的步骤进行的:

A:(a)固定 (b)透化 (c)脱色 (d)折射率匹配

 

Q:组织透明化的优势

A:目前大多数可用的透明化技术,都是通过编码荧光报告蛋白或者用荧光标记抗体进行后标记,从而可视化

A:组织中特定的蛋白。组织透明化成为了具有单细胞分辨率的组织3D成像中重要的一环。

 

Q:透明化技术的比较

A:下面是水性的透明化技术。


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂


A:SeeDB(基于果糖的方法)在一些应用中有一定优势。因为SeeDB不含去垢剂,所以对于透明化DiI(细胞膜

A:红色荧光探针,一种神经示踪剂)标记的样品和使用光电关联显微镜(CLEM)的情况下,SeeDB有着一定优

A:势。另外SeeDB会产生自体荧光,有时候会对辨认未标记的神经元结构(如神经毡)起着一定帮助。

A:SeeDB2是为使用高NA物镜的高分辨率成像而优化的技术;因此,当处理较大的组织时,CLARITY或者CUBIC

A:会是更好的选择。

 

Q:切片厚度的最大值和最小值?

A:您应该根据您的物镜的WD(工作距离)来决定切片的厚度。我们建议切片的厚度不要超过3mm。对于十分薄

A:且脆弱的样品,我们建议使用琼脂糖包埋。

A:使用CUBIC,可以让全器官、全身透明化和使用LSFM的快速3D成像具有可重复性。

 

Q:试剂盒成分

A:具体如下:

A:1. SCALEVIEW-S试剂盒(299-79001)适用于20份1-2mm的切片样品

A:A:1) SCALEVIEW-S0——100 mL

A:A:2) SCALEVIEW-S1——100 mL

A:A:3) SCALEVIEW-S2——100 mL

A:A:4) SCALEVIEW-S3——100 mL

A:A:5) SCALEVIEW-S4——100 mL

A:A:6) SCALEVIEW-SMT——100 mL

 

A:2. SCALEVIEW-S试剂盒(290-80801)适用于20-30份1-2 mm的切片样品。

A:A:1) SCaleCUBIC-1 Solution——250 mL

A:A:2) SCaleCUBIC-2 Solution——250 mL

A:A:3) Mounting Solution 1——40 mL

A:A:4) Mounting Solution 2——40 mL

 

A:3. SeeDB试剂盒(299-79901)适用于20-30份1-2 mm的切片样品。

A:A:1) SeeDB:20w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:2) SeeDB:40w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:3) SeeDB:60w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:4) SeeDB:80w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:5) SeeDB:100w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:6) SeeDB——50 mL

 

A:4. SeeDB2试剂盒(294-80701)适用于20-30份1-2 mm的切片样品。

A:A:1) Saponin(皂角苷)——5 g

A:A:2) SeeDB2G solution——50 mL

A:A:3) SeeDB2S solution——50 mL

A:A:4) PBS——50 mL

 

Q:样品的保存

A:SCALEVIEW-S处理的样品应在室温下保存2至3周。您可以在2至3周内观察SCALEVIEW-S透明化的样品中的

A:荧光信号。

A:CUBIC处理的样品应在室温下保存1周。您可以在1周内观察CUBIC透明化的样品中的荧光信号。

A:SeeDB2G处理的样品应在冰箱中保存1年,而SeeDB2S处理的样品则可在室温下保存1年。您可以在1年内观

A:察SeeDB透明化的样品中的荧光信号。

 

Q:抗体的荧光标记

A:应在进行透明化前就进行抗体的荧光标记。

 

Q:适用于SCALEVIEW-S的显微镜

A:SD-OSR(Olympus)

A:FV-OSR(Olympus)

 

Q:适用于CUBIC的显微镜

A:SD-OSR(Olympus)

A:FV-OSR(Olympus)

A:Zeiss Lightsheet Z.1(Carl Zeiss)

 

Q:适用于SeeDB2的显微镜

A:Confocal(最好使用高NA的油浸镜头)

A:STED(Leica Microsystems)

A:SR-SIM(Carl Zeiss)

A:SD-OSR(Olympus)

A:FV-OSR(Olympus)

A:Airyscan(Carl Zeiss)

A:HyVolution(Leica Microsystems)

A:Two-photon(最好使用复合浸没镜头)

A:Confocal(最好使用高NA的甘油浸镜头)

A:Light-sheet DLS(Leica,最好使用定制镜面的设备)

 

Q:重构

A:对于定量用途,我们建议使用Neurolucida系统(MBF)。我们同样测试了VAST Lite用于成像用途时的表

A:现。重构时也可以使用开源软件。例如,Vaa3d可以处理大量的拼接图像的数据。

 

Q:物镜推荐


SCALEVIEW-S                              组织透明化试剂

 

Q:其他物种?其他器官?

A:对于昆虫样品和鱼类样品,建议选择CUBIC。

A:昆虫相关文献:Ohuma.et al.: Fish Pathology, 52(2), 96(2017).

A:鱼类相关文献:Konno and S.Okazaki .: Zoological Letters, 4:13(2018).

   


  对于多细胞球状体,选择SCALEVIEW-S会更好。

  https://www.nature.com/articles/s41598-018-29169-0

 

参考文献

[1]

Hama,H.et al.:ProtocolExchange(2016).doi:10.1038 /protex.2016.019.

[2]

Hama,H.et al.:Nat.Neurosci.,18,1518(2015).

[3]

濱裕、日置寛之、並木香奈、星田哲志、黒川裕、宮脇敦史:生体の科学,68(1),85(2017).

[4]

日置寛之、濱裕、孫在隣、黄晶媛、並木香奈、星田哲志、黒川裕、宮脇敦史:日本薬理学雑誌,

149 (4),173(2017).

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级
193-18455 SCALEVIEW-A2
SCALEVIEW® 组织透明化试剂A2
500 mL 组织透明化试剂
196-18521 SCALEVIEW-S0 250 mL 组织透明化试剂
193-18531 SCALEVIEW-S1
SCALEVIEW-S1组织透明化试剂
250 mL 组织透明化试剂
190-18541 SCALEVIEW-S2
SCALEVIEW-S2组织透明化试剂
250 mL 组织透明化试剂
197-18551 SCALEVIEW-S3
SCALEVIEW-S3组织透明化试剂
250 mL 组织透明化试剂
194-18561 SCALEVIEW-S4
SCALEVIEW-S4组织透明化试剂
250 mL 组织透明化试剂
191-18571 SCALEVIEW-SMt
SCALEVIEW-SMt组织透明化试剂
250 mL 组织透明化试剂
041-34425 deScale Solution 500 mL 组织透明化试剂
299-79901 SCALEVIEW-S Trial Kit 1 Kit 组织透明化试剂

CUBIC 组织透明化试剂

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CUBIC 组织透明化试剂CUBIC                              组织透明化试剂

具有单细胞分辨率的全脑/全身成像

CUBIC                              组织透明化试剂

*数据由Etsuo A Susaki博士和

Hiroki R. Ueda, RIKEN博士提供

  Hiroki R. Ueda博士等人开发了一种简单、高效、可扩展的脑/体透明化方法和成像/计算分析方法,CUBIC(clear, unobstructed brain/body imaging cocktails and computational analysis)。

  CUBIC是一种基于亲水溶液(ScaleCUBIC Solutions)的、具有荧光保护、高性能及无需特殊设备等特点的组织透明化方法。

  它可以利用LSFM技术实现可重复的整个器官和全身的透明化以及快速3D成像。CUBIC还提供3D图像的处理和分析,以提取生物信息。

  所以,CUBIC提供了具有单细胞分辨率和图像信息学的全器官/全身成像平台,使广大用户能够针对细胞和器官层进行多个样品的实验。

◆CUBIC的优点


● 易于使用

● 无需特殊设备

● 支持后续的2D H&E染色

● 高透明度

● 适用于多种器官

● 兼容IF(免疫荧光),FP(荧光蛋白)和其他荧光标记

◆CUBIC的应用


CUBIC                              组织透明化试剂


**一般情况下,可使用比例为7:3的固定溶液1和2(RI~1.49)混合溶液。

CUBIC                              组织透明化试剂

图1.使用Scale CUBIC Solution透明化前后小鼠整体器官的透射图像

CUBIC                              组织透明化试剂

图2.使用Scale CUBIC Solution透明化前后小鼠2mm切片的透射图像

◆ CUBIC应用于荧光蛋白表达


CUBIC                              组织透明化试剂

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CUBIC                              组织透明化试剂

图3CAG-EGFP Tg小鼠(8w雄性)的全脑,全心脏和解剖肝脏的LSFM成像

◆CUBIC应用于病理学方法中


  数据来源于S. Nojima.et al. : Scientific Reports ,7,9269 (2017)/已被收录


CUBIC                              组织透明化试剂

图4.使用CUBIC透明化各种人体器官

使用CUBIC的石蜡样品的组织透明化和3D成像


CUBIC                              组织透明化试剂

图5.使用CUBIC的病理标本的组织透明化和3D成像




CUBIC 鱼类透明化案例


数据提供:东京海洋大学 海洋生物资源学院 二见邦彦老师


CUBIC                              组织透明化试剂

图6使用CUBIC的鱼类透明化案例

实验步骤参见参考文献5)

CUBIC                              组织透明化试剂

图7使用CUBIC处理后的鱼类内脏切片案例

-CUBIC处理后,切片5 μm,可用Mayer’s Hematoxylin染色-

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图8用抗体观察CUBIC处理后斑马鱼鳃的内脏片

◆CUBIC 甲壳类(螃蟹·鼠妇)透明化案例


数据提供:浜松医科大学 医学分光应用寄附研究生 绀野在老师,冈崎茂俊老师


CUBIC                              组织透明化试剂

图9使用CUBIC的甲壳类透明化案例(上:螃蟹,下:鼠妇)

实验步骤参见参考文献6)

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图10观察CUBIC处理后(PI染色)甲壳类的全身(左:螃蟹,右:鼠妇)

实验步骤参见参考文献6)

※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。

注意:

  列出的产品仅供实验室研究使用,不得用于药物、食品或人体。

组织透明化配套耗材:成像用透明室

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CUBIC trial manual.pdf

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透明化试剂方法选择流程

CUBIC trial manual

CUBIC                              组织透明化试剂

组织透明试剂化系列

组织透明化试剂Q&A ver1.0

Tissue clearing reagent Q&A ver1.0

Q组织透明化的原则

A:组织透明化通常是按下面的步骤进行的:

A:(a)固定 (b)透化 (c)脱色 (d)折射率匹配

 

Q:组织透明化的优势

A:目前大多数可用的透明化技术,都是通过编码荧光报告蛋白或者用荧光标记抗体进行后标记,从而可视化

A:组织中特定的蛋白。组织透明化成为了具有单细胞分辨率的组织3D成像中重要的一环。

 

Q:透明化技术的比较

A:下面是水性的透明化技术。

CUBIC                              组织透明化试剂


CUBIC                              组织透明化试剂

A:SeeDB(基于果糖的方法)在一些应用中有一定优势。因为SeeDB不含去垢剂,所以对于透明化DiI(细胞膜

A:红色荧光探针,一种神经示踪剂)标记的样品和使用光电关联显微镜(CLEM)的情况下,SeeDB有着一定优

A:势。另外SeeDB会产生自体荧光,有时候会对辨认未标记的神经元结构(如神经毡)起着一定帮助。

A:SeeDB2是为使用高NA物镜的高分辨率成像而优化的技术;因此,当处理较大的组织时,CLARITY或者CUBIC

A:会是更好的选择。

 

Q:切片厚度的最大值和最小值?

A:您应该根据您的物镜的WD(工作距离)来决定切片的厚度。我们建议切片的厚度不要超过3mm。对于十分薄

A:且脆弱的样品,我们建议使用琼脂糖包埋。

A:使用CUBIC,可以让全器官、全身透明化和使用LSFM的快速3D成像具有可重复性。

 

Q:试剂盒成分

A:具体如下:

A:1. SCALEVIEW-S试剂盒(299-79001)适用于20份1-2 mm的切片样品

A:A:1) SCALEVIEW-S0——100 mL

A:A:2) SCALEVIEW-S1——100 mL

A:A:3) SCALEVIEW-S2——100 mL

A:A:4) SCALEVIEW-S3——100 mL

A:A:5) SCALEVIEW-S4——100 mL

A:A:6) SCALEVIEW-SMT——100 mL

 

A:2. CUBIC Trial Kit(290-80801)适用于20-30份1-2 mm的切片样品。

A:A:1) SCaleCUBIC-1 Solution——250 mL

A:A:2) SCaleCUBIC-2 Solution——250 mL

A:A:3) Mounting Solution 1——40 mL

A:A:4) Mounting Solution 2——40 mL

 

A:3. SeeDB试剂盒(299-79901)适用于20-30份1-2 mm的切片样品。

A:A:1) SeeDB:20w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:2) SeeDB:40w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:3) SeeDB:60w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:4) SeeDB:80w/v% Fructose Solution——50 mL

A:A:5) SeeDB:100w/v% Fructose Solution——50mL

A:A:6) SeeDB——50 mL

 

A:4. SeeDB2试剂盒(294-80701)适用于20-30份1-2 mm的切片样品。

A:A:1) Saponin(皂角苷)——5 g

A:A:2) SeeDB2G solution——50 mL

A:A:3) SeeDB2S solution——50 mL

A:A:4) PBS——50 mL

 

Q:样品的保存

A:SCALEVIEW-S处理的样品应在室温下保存2至3周。您可以在2至3周内观察SCALEVIEW-S透明化的样品中的

A:荧光信号。

A:CUBIC处理的样品应在室温下保存1周。您可以在1周内观察CUBIC透明化的样品中的荧光信号。

A:SeeDB2G处理的样品应在冰箱中保存1年,而SeeDB2S处理的样品则可在室温下保存1年。您可以在1年内观

A:察SeeDB透明化的样品中的荧光信号。

 

Q:抗体的荧光标记

A:应在进行透明化前就进行抗体的荧光标记。

 

Q:适用于SCALEVIEW-S的显微镜

A:SD-OSR(Olympus)

A:FV-OSR(Olympus)

 

Q:适用于CUBIC的显微镜

A:SD-OSR(Olympus)

A:FV-OSR(Olympus)

A:Zeiss Lightsheet Z.1(Carl Zeiss)

 

Q:适用于SeeDB2的显微镜

A:Confocal(最好使用高NA的油浸镜头)

A:STED(Leica Microsystems)

A:SR-SIM(Carl Zeiss)

A:SD-OSR(Olympus)

A:FV-OSR(Olympus)

A:Airyscan(Carl Zeiss)

A:HyVolution(Leica Microsystems)

A:Two-photon(最好使用复合浸没镜头)

A:Confocal(最好使用高NA的甘油浸镜头)

A:Light-sheet DLS(Leica,最好使用定制镜面的设备)

 

Q:重构

A:对于定量用途,我们建议使用Neurolucida系统(MBF)。我们同样测试了VAST Lite用于成像用途时的表

A:现。重构时也可以使用开源软件。例如,Vaa3d可以处理大量的拼接图像的数据。

 

Q:物镜推荐

CUBIC                              组织透明化试剂

 

Q:其他物种?其他器官?

A:对于昆虫样品和鱼类样品,建议选择CUBIC。

A:昆虫相关文献:Ohuma.et al.: Fish Pathology, 52(2), 96(2017).

A:鱼类相关文献:Konno and S.Okazaki .: Zoological Letters, 4:13(2018).

   

  对于多细胞球状体,选择SCALEVIEW-S会更好。

  https://www.nature.com/articles/s41598-018-29169-0

 

参考文献


[1] E. A. Susaki. et al. : Cell ,157(3),726(2014).

[2] K. Tainaka. et al. : Cell ,159(4),911(2014).

[3] E. A. Susaki. et al. : Nature Protocols ,10,1709(2015).

[4] S. Nojima. et al. : Scientific Reports ,7,9269 (2017).

[5] S. Ohnuma. et al.: Fish Pathology, 52(2), 96(2017).
[6] A. Konno and S. Okazaki.: Zoological Letters, 4:13(2018).

产品编号 产品名称 产品规格 产品等级
290-80801 CUBIC Trial Kit
CUBIC试剂盒试用装
1 Kit 组织透明化试剂