从植物组织提取RNA试剂盒
ISOSPIN Plant RNA
ISOSPIN Plant RNA用于从植物组织提取和纯化RNA。本产品的原理是在离液剂离子条件下,RNA吸附于二氧化硅。无需苯酚和氯仿等有毒有机溶剂。所使用的离心柱最大限度地确保了柱容积,内封的硅胶模确保足够的RNA吸附容量和高洗脱率。
本试剂盒采用离心法去除杂物,在硅胶模上进行 DNase I 处理,提取和纯化高纯度RNA用时仅约1小时。
◆特点
• 高纯度 RNA
离心法去除杂物和硅基质膜上的 DNase I 处理能提取出高纯度RNA。
• 无需使用过滤器
无需使用过滤器样品均匀化或过滤时后。本试剂盒用离心法去除杂物沉淀。
• 无需苯酚、氯仿
无需使用苯酚、氯仿等有毒有机溶剂。
• 包装附有 DNase I
试剂盒内含有 DNase I (RNase free),不需另外购买。
◆产品列表
ISOSPIN Plant RNA (50次用量)
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产品
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容量
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保存
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备注
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PT Extraction Buffer
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30 mL x 1支
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室温
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PT Binding Buffer
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40 mL x 1支
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室温
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含乙醇
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PT Wash1 Buffer
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40 mL x 1支
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室温
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含乙醇(清洗液)
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PT Wash2 Buffer
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40 mL x 1支
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室温
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含乙醇(清洗液)
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DNase I (RNase free)
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2,000 units x 1支
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-20°C
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10× DNase I Buffer
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1 mL x 1支
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-20°C
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ddWater (RNase free)
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1 mL x 8支
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室温
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调制DNase I 溶液・洗提
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离心柱
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50 支 x 1袋
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冷藏
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上端组成:吸附柱 下端组成:收集管
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运送方法
NIPPON GENE提供直送服务,将室温品和冷藏品的试剂盒、-20°C的产品、放入干冰的泡沫箱一同放入纸箱,在常温下进行运输。
◆使用实例
Data.1 RNA的回收量标准
本产品可提取的RNA的回收量标准如下表。
样品
菠菜(叶)
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0.5 μg RNA/mg 组织
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青花菜(芽)
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1.0 μg RNA/mg组织
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卷心菜(种子)
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1.3 μg RNA/mg组织
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卷心菜(芽)
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1.4 μg RNA/mg组织
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卷心菜(叶)
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0.1 μg RNA/mg组织
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竹子(叶)
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0.3 μg RNA/mg组织
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郁金香(球根)
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0.2 μg RNA/mg组织
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Data.2 从卷心菜(十字花科)种子及从叶子提取RNA
使用ISOSPIN Plant RNA与其他公司产品按照步骤提取卷心菜的种子(约 4 mg)和叶(约 30 mg)的RNA。用吸收光谱和凝胶电泳对提取出的RNA进行比较。以提取出的总RNA为模板逆进行转录,使用GeneAce SYBRR qPCR Mix α Low ROX对获得的cDNA进行实时qPCR。
实验条件
1. 样品量
・种子(约4 mg)
・叶(约30 mg)
2. 变性凝胶电泳
・凝胶:1% Agarose S(甲醛变性)
・RNA添加量:种子(1 μg)/叶(0.5 μg)
・RNA Ladder:与RNA添加量等量
3. 实时qPCR
・试剂:GeneAce SYBRR qPCR Mix α Low ROX
・装置:ABI 7500 Fast
・模板cDNA:以提取出的总RNA为模板进行逆转录
・扩增片段长度:441 bp
・实验次数: n=3
结果
从吸收光谱结果看,在A230峰值上ISOSPIN Plant RNA比A公司低,说明本产品更能有效去除多糖类杂物(图1)。
卷心菜种子
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卷心菜叶
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图1 吸收光谱
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【RNA添加量】
种子(1 μg)/叶子(0.5 μg)
【Marker】 RNA Ladder(与RNA的添加量等量) 1% Agarose S(甲醛变性)
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图2 变性凝胶电泳
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卷心菜种子
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卷心菜叶
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图3 实时qPCR
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【试剂】
GeneAce SYBR® qPCR Mix α Low ROX
【模板】
以提取出的总RNA为模板进行逆转录
【装置】ABI 7500 Fast
【扩增片段长度】441 bp
【循环数】n=3
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红色: ISOSPIN Plant RNA 绿色: A公司产品
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Data.3 从竹子(禾本科)愈伤组织提取RNA
竹子愈伤组织
(淡竹培养细胞系Pn(rpc00047)形成)
使用ISOSPIN Plant RNA与其他公司产品,按照步骤对各样品量竹子愈伤组织提取RNA。通过吸收光谱和凝胶电泳对提取出的RNA进行比较。以提取出的总RNA为模板进行逆转录,使用 GeneAce SYBRR qPCR Mix α Low ROX 对获得的 cDNA 进行实时 qPCR。
※本实验使用的竹子愈伤组织由富山县立大学荻田信二郎博士(现公立大学法人县立广岛大学)提供。竹子愈伤组织委托理化学研究所 BioResource Center 获得的淡竹培养细胞系Pn(rpc00047)培养形成的。
实验条件
1. 样品量
① 约 65 mg
② 约 50 mg
③ 约 40 mg
2. 琼脂糖凝胶电泳
・凝胶:0.8% 琼脂糖 S/TAE
・RNA添加量:最终提取量的1/10(5 μL)
・Marker:OneSTEP Marker6(5 μL)
3. 实时qPCR
・试剂:GeneAce SYBR® qPCR Mix α Low ROX
・装置:ABI 7500 Fast
・模板cDNA:以提取的总RNA为模板进行逆转录
・扩增片段长度:197 bp
・循环数: n=3
结果
从吸收光谱结果看,在A230峰值上ISOSPIN Plant RNA比A公司低,说明更能有效去除多糖类杂物(图1)。根据琼脂糖凝胶电泳比较结果显示,ISOSPIN Plant RNA更有效提取出RNA(图2)。
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图1 吸收光谱
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图2 变性凝胶电泳
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【凝胶】
0.8% 琼脂糖 S/TAE
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【RNA添加量】
最终提取量的1/10(5 μL)
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【Marker】
OneSTEP Marker6(5 μL)
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【试剂】GeneAce SYBR® qPCR Mix α Low ROX
【装置】ABI 7500 Fast
【模板cDNA】以提取出的总RNA为模板进行逆转录
【扩增片段长度】197 bp
【循环数】n=3
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图3 实时qPCR
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Data.4 从郁金香(百合科)球根中提取RNA
提取液的粘性状态
左:ISOSPIN Plant RNA
右:B公司产品
使用 ISOSPIN Plant RNA 与B公司产品,按照步骤对郁金香球根(100 mg)提取RNA。通过吸收光谱和凝胶电泳对提取出的RNA进行比较。以提取出的总RNA为模板进行逆转录,使用 GeneAce SYBRR qPCR Mix α Low ROX 对获得的 cDNA 进行实时qPCR。
郁金香球根样品粘性高,提取困难。郁金香球根在液氮中碎成粉末状后,取1.5 mL移至离心管,并在各公司提取Buffer中用研磨棒磨碎,右图将离心管倒置比较溶液的粘性。
实验条件
1. 样品量
100 mg
2. 琼脂糖凝胶电泳
RNA添加量:最终提取量的1/10(5 μL)
结果
ISOSPIN Plant RNA 也能从粘性高的郁金香球根提取出RNA。
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最终提取量的1/10(5 μl)
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图1吸收光谱
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图2 琼脂糖凝胶电泳
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◆备注
· 本产品仅用于实验研究,不能作医药及其他目的使用。