Next® 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物试剂盒(Unique 双端 Index 引物) |NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品信息

NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物试剂盒(Unique 双端 Index 引物)适用于 Illumina® 测序平台,包含 NEBNext EM-seq™ 接头和 NEBNext PCR 引物,可在文库扩增过程中引入 Unique 双端 Index 引物。

96 次反应的试剂盒含有一板一次性的密封着可穿刺的铝箔封板膜 96 孔板。96 孔板的每个孔都含有一对唯一的 i5 和 i7 Index 引物,因此共提供 96 种 Unique 双端 Index 引物。对于 24 次反应的试剂盒,Index 引物封装在 24 个单独的小管中,每个小管都含有一对独特的 i5 和 i7 Index 引物。24 次和 96 次反应试剂盒中提供的 i5 和 i7 Index 引物之间没有重复。

虽然 NEBNext EM-seq 接头针对 EM-seq 实验流程进行了优化,但同样适用于重亚硫酸盐测序实验流程。

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒(NEB #E7120)也提供这些组份。

产品类别:
NEBNext® Multiplex Oligos (Adaptors & Primers) Products,
Epigenetic Analysis Products,
Epigenetics Products,

Next Generation Sequencing Library Preparation Products

应用:
DNA Methylation Analysis,
Bisulfite Conversion,
Epigenetics

  • 试剂盒组成

    本产品提供以下试剂或组分:

    NEB # 名称 组分货号 储存温度 数量 浓度
    • E7140S     -20    
        EM-seq™ Index Primer 1 (S) E7141AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 2 (S) E7142AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 3 (S) E7143AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 4 (S) E7144AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 5 (S) E7145AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 6 (S) E7146AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 7 (S) E7147AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 8 (S) E7148AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 9 (S) E7149AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 10 (S) E7150AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 11 (S) E7151AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 12 (S) E7152AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 13 (S) E7153AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 14 (S) E7154AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 15 (S) E7155AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 16 (S) E7156AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 17 (S) E7157AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 18 (S) E7158AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 19 (S) E7159AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 20 (S) E7160AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 21 (S) E7161AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 22 (S) E7162AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 23 (S) E7163AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        EM-seq™ Index Primer 24 (S) E7164AVIAL -20 1 x 0.005 ml 10 µM
        NEBNext® EM-seq™ Adaptor E7165AVIAL -20 1 x 0.06 ml Not Applicable
    • E7140L     -20    
        NEBNext® 96 Unique Dual Index Primer Pairs Plate (L) E7166AVIAL -20 1 x 5 μl/well 10 µM
        NEBNext® EM-seq™ Adaptor E7165AAVIAL -20 1 x 0.24 ml Not Applicable

操作说明、说明书 & 用法

  • 操作说明

    1. Where can I find protocols for using the NEBNext® Enzymatic Methyl-seq Kit? (NEB #E7120, E7125, E7140)

  • 说明书

    产品说明书包含产品使用的详细信息、产品配方和质控分析。

    • manualE7140

  • 使用指南

    • E7140L_E7120L_EMSeqUDI_IlluminaLRM
    • E7140S_E7120S_EMSeqUDI_IlluminaLRM
    • Forward Strand Workflow Sample Sheet for E7140L: NovaSeq 6000 with v1.0 reagent kits, MiniSeq with Rapid reagent kits, MiSeq, HiSeq 2000/2500 (paired-end flow cell), HiSeq 3000/4000 (single-read flow cell)
    • Forward Strand Workflow Sample Sheet for E7140S: NovaSeq 6000 with v1.0 reagent kits, MiniSeq with Rapid reagent kits, MiSeq, HiSeq 2000/2500 (paired-end flow cell), HiSeq 3000/4000 (single-read flow cell)
    • Reverse Complement Workflow Sample Sheet for E7140L: iSeq 100, MiniSeq with Standard reagent kits, NextSeq Systems, NovaSeq 6000 with v1.5 reagent kits, HiSeq 2000/2500 (single-read flow cell), HiSeq 3000/4000 (paired-end flow cell)
    • Reverse Complement Workflow Sample Sheet for E7140S: iSeq 100, MiniSeq with Standard reagent kits, NextSeq Systems, NovaSeq 6000 with v1.5 reagent kits, HiSeq 2000/2500 (single-read flow cell), HiSeq 3000/4000 (paired-end flow cell)

工具 & 资源

  • 选择指南

    • NEBNext® Multiplex Oligos Selection Chart

FAQs & 问题解决指南

  • FAQs

    1. What is provided in the NEBNext Multiplex Oligos for Enzymatic Methyl-seq?
    2. Can the NEBNext® Multiplex Oligos for Enzymatic Methyl-seq be used to address “index hopping” with Illumina patterned flow cells?
    3. How many indices are available with the 24 reaction- or 96 reaction-size of the NEBNext® Multiplex Oligos for Enzymatic Methyl-seq?
    4. Are the NEBNext® Multiplex Oligos for Enzymatic Methyl-seq the same as NEBNext® Multiplex Oligos for Illumina®?
    5. Are the EM-seq Adaptor and Index Primers validated in the EM-seq workflow?
    6. What is the concentration of the EM-seq Adaptor and Index Primers?
    7. How many reactions worth of primer are in each well/tube?
    8. Can I use the 96-well primer plate to do my PCR reactions?
    9. Do I need to spike in custom sequencing primers when sequencing libraries made with NEBNext® Multiplex Oligos for Enzymatic Methyl-seq on Illumina sequencing instruments?
    10. Can I perform single read runs and still get both index sequences? Can I run both single read and paired-end recipes with dual-indexed libraries?
    11. Are Sample Sheets available for use with the NEBNext® Multiplex Oligos for EM-seq?
    12. Can the EM-seq Adaptor be used for bisulfite sequencing?
    13. Are dual indexed libraries compatible with single end sequencing?
    14. What sequences need to be trimmed for NEBNext libraries that are sequenced on an Illumina instrument?

Next® 表观遗传学引物试剂盒 2B(Unique 双端 Index 引物) |NEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品信息

在 PCR 过程中,使用这些独特的双端索引引物对引入索引,这些引物针对 Illumina 测序平台 NEBNext 表观遗传学实验流程进行了优化,包含 NEBNext E5hmC-seq。引物为减少标签跳跃而设计,能标记多个样本。提供 24 个预混的 i5 和 i7 8 碱基索引引物对,包装在一个一次性的密封着可穿刺的铝箔封板膜 24 孔板中,便于一次性使用。

NEBNext 表观遗传建库多样本引物试剂盒 2B(Unique 双端 Index 引物)(NEB #E3392S)和 96 次反应的 NEBNext 表观遗传建库多样本引物试剂盒 3(Unique 双端 Index 引物)(NEB #E3404S)引物兼容,组合使用可以标记多达 120 个样本。

使用 NEBNext 表观遗传建库多样本引物时,请参阅 NEBNext 酶学转化法 5hmC 甲基化建库试剂盒说明书(NEB #E3350)。

产品类别:
NEBNext® Multiplex Oligos (Adaptors & Primers) Products,
Methylome Analysis Products,
Next Generation Sequencing Library Preparation Products

  • 试剂盒组成

    本产品提供以下试剂或组分:

    NEB # 名称 组分货号 储存温度 数量 浓度
    • E3392S     -20    
        NEBNext® Primers for Epigenetics (Unique Dual Index Set 2B) Plate E3399AVIAL -20 1 x 5 μl/well 10 µM

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操作说明、说明书 & 用法

  • 操作说明

    1. Where can I find protocols for use of the NEBNext® Primers for Epigenetics (Unique Dual Index Set 2B), including index pooling guidelines? (NEB #E3392)

  • 说明书

    产品说明书包含产品使用的详细信息、产品配方和质控分析。

    • manualE3392_E3404

  • 使用指南

    • Forward Strand Workflow Sample Sheet for E3392: NovaSeq 6000 with v1.0 reagent kits, MiniSeq with Rapid reagent kits, MiSeq, HiSeq 2000/2500 (paired-end flow cell), HiSeq 3000/4000 (single-read flow cell)
    • NEB_E3392_UDI_IlluminaLRM
    • Reverse Complement Workflow Sample Sheet for E3392: iSeq 100, MiniSeq with Standard reagent kits, NextSeq Systems, NovaSeq 6000 with v1.5 reagent kits, HiSeq 2000/2500 (single-read flow cell), HiSeq 3000/4000 (paired-end flow cell)

工具 & 资源

  • Web 工具

    • NEBNext Selector

FAQs & 问题解决指南

  • FAQs

    1. Are Sample Sheets available for use with the NEBNext® Primers for Epigenetics?
    2. Are dual-indexed libraries compatible with single end sequencing?
    3. What is provided in the NEBNext® Primers for Epigenetics?
    4. Can the NEBNext® Primers for Epigenetics be used to address “index hopping” with Illumina® patterned flow cells?
    5. How many indices are available with the 24 reaction or 96 reaction size of the NEBNext® Primers for Epigenetics?
    6. Are the NEBNext® Primers for Epigenetics the same as NEBNext® Multiplex Oligos for Illumina®?
    7. Are the NEBNext® Primers for Epigenetics validated for the E5hmC-seq™ workflow?
    8. What is the concentration of the Index Primers in NEBNext® Primers for Epigenetics?
    9. How many reactions worth of primer are in each well for the NEBNext® Primers for Epigenetics?
    10. Can I use the 96-well primer plate supplied with the NEBNext® Primers for Epigenetics to do my PCR reactions?
    11. Do I need to spike in custom sequencing primers when sequencing libraries made with NEBNext® Primers for Epigenetics on Illumina® sequencing instruments?
    12. Can I perform single read runs and still get both index sequences? Can I run both single read and paired-end recipes with dual-indexed libraries?
    13. What sequences need to be trimmed for NEBNext libraries that are sequenced on an Illumina instrument?

Next® 表观遗传建库多样本引物试剂盒 3(Unique 双端 Index 引物) |NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品信息

在 PCR 过程中,使用这些独特的双端索引引物对引入索引,这些引物针对 Illumina 测序平台 NEBNext 表观遗传学实验流程进行了优化,包含 NEBNext E5hmC-seq。引物为减少标签跳跃而设计,能标记多个样本。提供 96 个预混的 i5 和 i7 8 碱基索引引物对,包装在一个一次性的密封着可穿刺的铝箔封板膜 96 孔板中,便于一次性使用。

NEBNext 表观遗传建库多样本引物试剂盒 3(Unique 双端 Index 引物)(NEB #E3404S)和 24 次反应的 NEBNext 表观遗传建库多样本引物试剂盒 2B(Unique 双端 Index 引物)(NEB #E3392S)引物兼容,组合使用可以标记多达 120 个样本。

使用 NEBNext 表观遗传建库多样本引物时,请参阅 NEBNext 酶学转化法 5hmC 甲基化建库试剂盒说明书(NEB #E3350)。

产品类别:
NEBNext® Multiplex Oligos (Adaptors & Primers) Products,
Methylome Analysis Products,
Next Generation Sequencing Library Preparation Products

  • 试剂盒组成

    本产品提供以下试剂或组分:

    NEB # 名称 组分货号 储存温度 数量 浓度
    • E3404S     -20    
        NEBNext® Primers for Epigenetics (Unique Dual Index Set 3) E3404AVIAL -20 1 x 5 μl/well 10 µM

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操作说明、说明书 & 用法

  • 说明书

    产品说明书包含产品使用的详细信息、产品配方和质控分析。

    • manualE3392_E3404

  • 使用指南

    • Forward Strand Workflow Sample Sheet for E3404: NovaSeq 6000 with v1.0 reagent kits, MiniSeq with Rapid reagent kits, MiSeq, HiSeq 2000/2500 (paired-end flow cell), HiSeq 3000/4000 (single-read flow cell)
    • NEB_E3404_UDI_IlluminaLRM
    • Reverse Complement Workflow Sample Sheet for E3404: iSeq 100, MiniSeq with Standard reagent kits, NextSeq Systems, NovaSeq 6000 with v1.5 reagent kits, HiSeq 2000/2500 (single-read flow cell), HiSeq 3000/4000 (paired-end flow cell)

工具 & 资源

  • Web 工具

    • NEBNext Selector

FAQs & 问题解决指南

  • FAQs

    1. Are Sample Sheets available for use with the NEBNext® Primers for Epigenetics?
    2. Are dual-indexed libraries compatible with single end sequencing?
    3. What is provided in the NEBNext® Primers for Epigenetics?
    4. Can the NEBNext® Primers for Epigenetics be used to address “index hopping” with Illumina® patterned flow cells?
    5. How many indices are available with the 24 reaction or 96 reaction size of the NEBNext® Primers for Epigenetics?
    6. Are the NEBNext® Primers for Epigenetics the same as NEBNext® Multiplex Oligos for Illumina®?
    7. Are the NEBNext® Primers for Epigenetics validated for the E5hmC-seq™ workflow?
    8. What is the concentration of the Index Primers in NEBNext® Primers for Epigenetics?
    9. How many reactions worth of primer are in each well for the NEBNext® Primers for Epigenetics?
    10. Can I use the 96-well primer plate supplied with the NEBNext® Primers for Epigenetics to do my PCR reactions?
    11. Do I need to spike in custom sequencing primers when sequencing libraries made with NEBNext® Primers for Epigenetics on Illumina® sequencing instruments?
    12. Can I perform single read runs and still get both index sequences? Can I run both single read and paired-end recipes with dual-indexed libraries?
    13. What sequences need to be trimmed for NEBNext libraries that are sequenced on an Illumina instrument?

Next® 多样本接头引物试剂盒 1(96 种 Unique 双端 Index 引物) |NEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品信息

NEBNext® 接头采用了一种新型的发卡环状结构,能以更高的效率连接末端经修复和加 dA 尾的 DNA 片段。环状结构 DNA 中包含一个 U,当 U 被 USER® 酶(UDG 和 Endo VIII 的混合物)切掉后,环状结构打开,使它可以成为 PCR 反应的底物。通过 NEBNext Index 引物在 PCR 步骤中引入 Barcode,从而有助于实现多重测序文库制备。此试剂盒包含 96 对预混合的独特的 i5 和 i7 Index 引物,封装在可穿透铝箔密封的一次性 96 孔板中。

NEBNext 接头引物可与 NEBNext 产品以及其它兼容 Illumina 平台的标准文库制备流程结合使用。

还提供双端 Barcode 引物(NEB #E7600、NEB #E7780),以及 12 种和 96 种单端 Index 引物(NEB #E7335、NEB #E7500、NEB #E7710、NEB #E7730、NEB #E6609)。也提供甲基化的 NEBNext 接头(NEB #E7535),可用于重亚硫酸盐测序流程。

流程:

NEBNext 接头专为 DNA、ChIP DNA 和 RNA(但不包括 Small RNA)文库制备而设计,能够实现高效的接头连接和高文库产量,并最大限度减少接头二聚体的形成。NEBNext 接头采用了一种新型的发卡环状结构,能以更高的效率连接末端经修复和加 dA 尾的 DNA 片段。环状结构 DNA 中包含一个 U,当 U 被 USER 酶(UDG 和核酸内切酶 Endo VIII 的混合物)切掉后,环状结构打开,使它可以成为 PCR 反应的底物。通过 NEBNext Index 引物在 PCR 步骤中引入 Barcode,从而有助于实现多重测序文库制备。此试剂盒包含 96 种预混合的 8 bp Index 引物,封装在可穿透铝箔密封的一次性 96 孔板中。

如需使用 384 种 Index 引物进行多重测序,请将此试剂盒与 NEB #E6442、NEB #E6444 和 NEB #E6446 结合使用。
 

图 1:演示使用 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(96 种 Unique 双端 Index 引物)的实验流程

Next® 多样本接头引物试剂盒 1(96 种 Unique 双端 Index 引物) |

 

图 2:使用 NEBNext 接头和 Unique 双端 Index 引物可显著提高文库产量并最大限度减少接头二聚体

Next® 多样本接头引物试剂盒 1(96 种 Unique 双端 Index 引物) |
以 100 ng 人源 NA19240 基因组 DNA(Coriell 研究所)为样本,用 NEBNext Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒构建 16 个文库。接头和引物来自 IDT® for Illumina® –TruSeq® DNA UD Index(Illumina #20022370),或 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1(96 种 Unique 双端 Index 引物)。4 个 PCR 循环后,用 Agilent® TapeStation® 4000 定量文库。A)使用 NEBNext 接头和 Unique 双端 Index 引物,以及其对应的实验流程制备的 8 个文库,平均文库产量提高了 60%。B)根据 16 个文库的 TapeStation 检测结果,使用 IDT for Illumina 接头和引物制备文库产生了接头二聚体(橙色箭头所示),而用 NEBNext 接头和引物制备文库未产生接头二聚体,且文库的产量也更高。

 

图 3:使用 NEBNext 96 种 Unique 双端 Index 引物扩增的文库在 Illumina® NovaSeq™ 6000 上发生均匀的簇生成

Next® 多样本接头引物试剂盒 1(96 种 Unique 双端 Index 引物) |
使用 NEBNext Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒(图 1)和 NEBNext 96 种 Unique 双端 Index 引物制备的 96 个文库以等摩尔浓度混合并用 Illumina NovaSeq 6000 仪器(2 x 150 bp)测序。汇总了所有文库的 Read 总数,并确定每个文库 Read 总数所占的比例(每个文库的预期比例 = 1.04%)。全部 96 个文库都发生有效的簇生成,并且都呈现近似预期的频率。

 

图 4:NEBNext 96 种 Unique 双端 Index 引物以同等效率扩增文库

Next® 多样本接头引物试剂盒 1(96 种 Unique 双端 Index 引物) |
以人源 NA19240 基因组 DNA(Coriell 研究所)为样本,使用 NEBNext Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒、Covaris 超声打断的 DNA 结合 NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒、Ultra II DNA 文库制备试剂盒结合重亚硫酸盐转化 DNA,或 NEBNext Ultra II RNA 链特异性文库制备试剂盒,制备 96 个文库。使用 NEBNext 96 种 Unique 双端 Index 引物对文库进行 PCR 扩增,生成包含独特 i5 和 i7 Index 的文库。使用 Agilent® TapeStation® 4200 对文库产量进行定量,并通过汇总全部 96 个文库的总产量和计算每个文库的占比进行标准化(每个文库的预期比例 = 1.04%)。每种文库制备方法的文库扩增效率都很稳健,而且全部 96 种 Unique Index 引物组合的效率都很一致。每根柱条代表至少 2 组平行重复实验的平均值。

 

图 5:Unique 双端 Index 引物可以识别和去除 Index-hopped 的 read。

Next® 多样本接头引物试剂盒 1(96 种 Unique 双端 Index 引物) |
一组 96 个 NEBNext Ultra II FS DNA 文库(图 2),用于评估 read 分类的准确性以及过滤使用 Unique 双端 Index 发生 Barcode-hopped 的 read。将 96 个文库以等摩尔浓度混合,并用 NovaSeq 6000(2 x 150 bp)和 MiSeq®仪器(2 x 76 bp)测序。考虑到 Index,使用 Picard ExtractIlluminaBarcodes 工具对 read 进行拆分,并将其分为以下类别:

  • 拆分的 read:预期的 i5 和 i7 Barcode 组合
  • 识别的 index hopping:符合预期的 barcode,但不是预期的组合
  • 深色簇:N 或 G read(由于四色测序,不能在 MiSeq 上观察到)
  • Phi X:任何与通用引物序列匹配的 read(MiSeq 实验中不存在)
  • 其它:任何不属于上述类别的剩余 read

使用单端 i5 或 i7 Index(或 i5 和 i7 的非唯一组合)进行拆分,将错误分配 NovaSeq 上约 5% 的 read 和 MiSeq 上 0.6% 的 read,导致错误分配样本之间的 read 并影响下游分析。Unique 双端 Index 不仅能够成功识别 read,还能在拆分过程中拒绝来源不明的 read。

图 6:利用 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1-4(96 种 Unique 双端 Index 引物)的 384 对引物扩增的文库在 Illumina NovaSeq™ 6000 上发生均匀的簇生成

Next® 多样本接头引物试剂盒 1(96 种 Unique 双端 Index 引物) |

使用 NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒(NEB #E7645)和 NEBNext 多样本接头引物试剂盒 1-4(96 种 Unique 双端 Index 引物)制备的 384 个文库,以等摩尔浓度混合并用 Illumina NovaSeq® 6000 仪器测序。汇总了所有文库的 Read 总数,并确定每个文库 Read 总数所占的比例(每个文库的预期比例 = 0.26%)。全部 384 个文库都发生有效的簇生成,并且都呈现近似预期的频率。
产品类别:
NEBNext® Multiplex Oligos (Adaptors & Primers) Products,
Next Generation Sequencing Library Preparation Products

  • 试剂盒组成

    本产品提供以下试剂或组分:

    NEB # 名称 组分货号 储存温度 数量 浓度
    • E6440S     -20    
        USER® Enzyme E6610AVIAL -20 1 x 0.288 ml Not Applicable
        NEBNext® 96 Unique Dual Index Primer Pairs Plate (L) E6441AVIAL -20 1 x 10 μl/well 10 µM
        NEBNext® Adaptor for Illumina® E6612AVIAL -20 1 x 0.96 ml 15 µM
    • E6440L     -20    
        USER® Enzyme E6610AAVIAL -20 2 x 0.576 ml Not Applicable
        NEBNext® 96 Unique Dual Index Primer Pairs Plate (L) E6441AVIAL -20 4 x 10 μl/well 10 µM
        NEBNext® Adaptor for Illumina® E6612AVIAL -20 4 x 0.96 ml 15 µM

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操作说明、说明书 & 用法

  • 操作说明

    1. Where can I find protocols for using NEBNext® Multiplex Oligos for Illumina® (96 Unique Dual Index Primer Pairs)? (NEB #E6440, #E6442, #E6444, #E6446, #E6448)

  • 说明书

    产品说明书包含产品使用的详细信息、产品配方和质控分析。

    • manualE6440

  • 使用指南

    • E6440_UDI_IlluminaLRM
    • Forward Strand Workflow Sample Sheet for E6440: NovaSeq 6000 with v1.0 reagent kits, MiniSeq with Rapid reagent kits, MiSeq, HiSeq 2000/2500 (paired-end flow cell), HiSeq 3000/4000 (single-read flow cell)
    • Reverse Complement Workflow Sample Sheet for E6440: iSeq 100, MiniSeq with Standard reagent kits, NextSeq Systems, NovaSeq 6000 with v1.5 reagent kits, HiSeq 2000/2500 (single-read flow cell), HiSeq 3000/4000 (paired-end flow cell)

工具 & 资源

  • 选择指南

    • NEBNext® Multiplex Oligos Selection Chart

FAQs & 问题解决指南

  • FAQs

    1. Are NEBNext adaptors and primers for Illumina validated in Next Generation Sequencing Workflows?
    2. What is the concentration of the adaptor and primers in the NEBNext Multiplex Oligos kits?
    3. Can I use the 96-well primer plate to do my PCR reactions?
    4. How many reactions worth of primer are in each well?
    5. Is the NEBNext adaptor methylated?
    6. Can I perform single read runs and still get both index sequences? Can I run both single read and paired-end recipes with dual-indexed libraries?
    7. Are dual indexed libraries compatible with single end sequencing?
    8. How many indices are available with NEBNext® Multiplex Oligos for Illumina® (96 Unique Dual Index Primer Pairs) (NEB #E6440, E6442, E6444, E6446, and E6448)?
    9. Can the NEBNext Multiplex Oligos for Illumina (96 Unique Dual Index Primer Pairs) (NEB #E6440, #E6442, #E6444, #E6446, and #E6448) be used to address “index hopping” with Illumina patterned flow cells?
    10. Where can I find the sample sheets for these Multiplex Oligos?
    11. Which sets of NEBNext Unique Dual Index Primer Pairs can be combined in a single Illumina sequencing run?
    12. How do I use the NEB provided Sample Sheet for my specific instrument?
    13. What sequences need to be trimmed for NEBNext libraries that are sequenced on an Illumina instrument?